Kelompok Penelitian atau research cluster adalah kumpulan dari kegiatan penelitian dengan tema yang serupa. Kelompok penelitian juga merupakan kumpulan dari pengalaman, latar belakang dan core competence individual dengan isu atau tema yang serua. Dengan demikian kelompok ini menampung peneliti dari kelompok penelitian yang berbeda, untuk menggarap isu yang berbeda namun dengan pendekatan yang dimiliki oleh individu tersebut. Hal tersebut dimungkinkan karena pendekatan yang dikembangkan adalah pendekatan multidisiplin. Di PMB LIPI ini terdapat 4 Kelompok penelitian yaitu Kelti Hukum dan Masyarakat, Kelti Ekologi Sosial dan Kesejahteraan Masyarakat, Kelti Agama dan Filsafat dan Kelti Kebudayaan dan Multikulturalisme.
Adapun tim yang berada pada kelompok tersebut adalah:
Kelti Hukum dan Masyarakat
Penguatan Partisipasi Warga Komunitas dalam Upaya Pencegahan Kejahatan di Ruang Sewa Wilayah Permukiman
Hak Ekonomi, Sosial dan Budaya (Ekosob) Warga Negara dan Pemenuhannya di Tengah Perubahan Lokal, Nasional dan Global
Kelti Ekologi Sosial dan Kesejahteraan Masyarakat
Pelayaran Tradisional Komunitas Maritim Indonesia
Tata Kelola Hutan Gambut: Menuju Pengelolaan yang Berkelanjutan
Partisipasi Stakeholder dalam Pembangunan Perkotaan Inklusif: Perencanaan dan Implementasi Kebijakan Sosial
Kelti Agama dan Filsafat
Pluralitas dan Minoritas : Kajian tentang Penanganan dan Perlakuan Terhadap Agama Minor di Indonesia
Agama Pribumi dan Negara: Politisasi Agama dan Strategi Pengelolaan Keberagaman dan Keragaman di Indonesia
Dinamika Pelaksanaan Syariat Islam dan Implikasinya terhadap Keutuhan Masyarakat Indonesia
Kelti Kebudayaan dan Multikulturalisme
Pengelolaan Bahasa dan Kebudayaan Daerah untuk Memperkuat Integrasi Nasional
Media Baru dan Perubahan Masyarakat Pascaorde Baru
Ilmu Pengetahuan, Teknologi dan Masyarakat: Proses, Kebijakan dan Prospeknya di Indonesia